Dalam biologi, untuk menerangkan organisma tertentu, yang tergolong dalam kerajaan haiwan, kulat atau tumbuhan, tatanamanya sendiri telah dibangunkan. Ia mencerminkan kepunyaan satu spesies, bergantung pada ciri-ciri morfologi dan rupa. Bagi haiwan, kriteria untuk merujuk kepada spesies digunakan, bergantung kepada keupayaan untuk menghasilkan anak yang subur semasa persenyawaan. Walau bagaimanapun, corak ini hanya terpakai kepada organisma ini, manakala mikrob tidak boleh dikelaskan dengan cara ini.
Konsep terikan dalam mikrobiologi
Disebabkan kehadiran sejumlah besar organisma yang mempunyai sifat morfologi, tetapi ciri biokimia dan imunologi yang berbeza, adalah mustahil untuk menggunakan tatanama standard untuk penamaan. Akibatnya, konsep seperti strain telah diperkenalkan. Ini adalah budaya tulen mikrob yang telah diasingkan dan diasingkan di tempat tertentu pada jam tertentu.
Setiap mikrob yang tergolong dalam satu strain adalah serupa dengan wakil yang lain dari segi kriteria biokimia, morfologi, imunologi dan genetik. Tetapi dalam spesies bakteria yang sama, analogi sedemikian tidak diperhatikan. Oleh itu, strain ialah nama yang lebih fleksibel untuk kultur mikrob. Sebab cepatpertukaran bahan genetik (mutasi) membawa kepada kemunculan organisma baharu dalam spesies, tetapi dengan sifat yang berbeza, takrifan inilah yang membolehkan kita mencirikan faktor patogenik dan virulensi dengan lebih tepat.
Terikan bakteria
Nomenklatur bakteria sedia ada memungkinkan untuk mengklasifikasikan jenis organisma, tetapi tidak mencirikan sifat baharunya. Yang terakhir muncul akibat mutasi pesat, memperoleh sifat baru, termasuk yang patogen untuk manusia, haiwan ternakan dan tumbuhan, serta mikrob lain. Contoh tatanama menggunakan contoh Escherichia coli kelihatan seperti ini: kerajaan - bakteria, jenis - Proteobacteria, kelas gamma-proteobacteria, perintah - Enterobacteriales, keluarga Enterobacteria. Genusnya ialah Escherichia dan spesiesnya ialah Escherichia colli. Walau bagaimanapun, terdapat banyak kultur bakteria spesies Escherichia colli, menunjukkan sifat yang berbeza. Mereka diasingkan kepada strain bakteria yang berasingan dan mempunyai nama tambahan. Contohnya, Escherichia colli O157:H7.
E. coli sendiri terdapat dalam usus manusia dan tidak menyebabkan penyakit, tetapi strain O157:H7 secara eksklusif bersifat patogenik kerana kehadiran sejumlah besar faktor virulensi. Dia telah mengalami wabak penyakit enterotoksigenik dalam tempoh 5 tahun yang lalu.
Jenis virus
Konsep terikan ialah nama fleksibel untuk organisma dengan sifat yang sama yang telah diasingkan, dan kemudian dikenal pasti dan diterangkan di kawasan tertentu pada masa tertentu. Dengan perjalanannya, virus boleh memperoleh sifat baru kerana antigenikhanyut. Ini akan menghasilkan strain virus baharu, mungkin lebih patogenik daripada induknya.
Anda boleh menunjukkan dengan jelas kemunculan strain baharu menggunakan contoh virus influenza. Ia tergolong dalam keluarga Orthomyxovirus dan dinamakan bergantung kepada antigen (hemagglutinin dan neuraminidase) HxNy. X dan Y adalah nilai berangka yang mencerminkan kehadiran antigen. Contohnya ialah H5N1, yang terkenal dengan wabak selesema babi baru-baru ini dengan pneumonia hemoragik yang progresif dengan cepat. Menurut teori, strain baru dan lebih berbahaya boleh berkembang daripada strain ini disebabkan oleh drift antigen yang sama.
Terikan kulat dan strain protista
Acuan ialah pembolehubah paling sedikit daripada semua mikrob, walaupun biokimianya juga kompleks. Oleh kerana struktur yang lebih kompleks daripada bakteria dan virus, dan juga kerana kekurangan mekanisme untuk pemindahan gen pantas, bilangan strain kulat baru meningkat sedikit. Terdapat juga pendapat bahawa mana-mana strain kulat yang baru ditemui ialah organisma sedia ada yang langsung tidak ditemui oleh penyelidik.
Situasi yang sama wujud dalam kerajaan protista. Keupayaan mereka untuk bermutasi adalah rendah, jadi kemungkinan strain baru akan muncul dengan cepat adalah sangat kecil. Walau bagaimanapun, varian baru organisma spesies yang sama masih muncul. Oleh itu, nampaknya, ia juga wujud lebih awal, tetapi tidak ditemui.
